Protokollene som brukes i QSAR

QSAR står for kvantitative struktur aktivitet forholdet. Brukt til å vise hvordan en kjemisk struktur kvantitativt kan korreleres til en spesifikk prosess blir QSAR ofte brukt for å utforme medikamenter og narkotika. Denne metodikken brukes til å veilede kjemisk syntese, som det finnes mange tusen forskjellige mulige strukturer for ett molekyl og forskere ellers kaste bort en masse tid på å teste hver enkelt struktur. Statistikk spille en viktig rolle i metodikken for QSAR. Multippel lineær regresjon

Multippel lineær regresjonsanalyse brukes når det er flere studier som brukes som alle er knyttet til en bestemt kjemisk struktur. En ligning er utviklet som, for eksempel, kan vise et forhold mellom reduksjon av tumorstørrelse og tilstedeværelsen av en hydrofob gruppe på den fjerde posisjonen til en fenylring. Denne analysen reduserer mange forskjellige forbindelser slik at sammenhengen kan tolkes ved hjelp av bare noen få parametere som er det viktigste.
Pattern Recognition

Mønstergjenkjenning brukes til å definere parametre som oppstår når den kjemiske strukturen er gruppert sammen. Det finnes flere forskjellige typer av mønstergjenkjenning analyse, som inkluderer prinsipal komponent analyse, datamaskin automatiserte struktur evaluering og automatisert data analyse av mønstergjenkjenning teknikker. Mønstergjenkjenning statistikk brukes originale data og vil relatere de ulike strukturene med de biologiske resultatene basert på forskjellige dimensjoner, med de mest betydningsfulle vesen i første beregnet komponent.
Comparative Molecular Felt Analyse

Denne versjonen av QSAR tar delvis minste kvadraters analyse sammen med kryssvalidering å lage prognoser for den biologiske aktiviteten. I denne typen metodikk, vil forskeren tilordne bestemte regler for justering av molekylstrukturen. Hver av de molekylene er passe inn i et rutenett, og deretter ulike interaksjoner er beregnet basert på samhandling fra en sonde atom til de ulike nett. Det er mange forskjellige ligninger som kan føre til. I motsetning til andre typer regresjon, produserer dette ligninger der det er mye mer parametere enn mulige forbindelser
Apex -. 3D

Apex-3D bruker et system som automatisk velger den beste justering og konformasjon for strukturene basert på den nødvendige biologiske respons fra tidligere eksperimenter. Det er mulig å avdekke effekten av forskjellig orientering binding,-antagonist-aktivitet versus agonist aktivitet og effekt av forskjellige reseptorer. Dette genererer 2D og 3D topografiske matriser og kan generere informasjon for par av molekyler snarere enn single molekyler.
Genetisk Function Tilnærming

Genetisk funksjon tilnærming brukes når det er få prøver og mange forskjellige variabler som undersøkes, og når datasettene ikke har lineære sammenhenger. Dette bruker beste karakter modeller og verste karakter modeller beregnet ut fra rådata. Det bygger bedre og bedre kvalitet modeller ved å bytte ut de verste karakter modeller. De mange forskjellige flere anfall blir deretter gitt til forskeren, som deretter velger den endelige modellen. Likhetene mellom modellene er studert for å gi informasjon om de strukturelle og biologiske sammenhenger.