Fordelene ved å bruke gelelektroforese

Gelelektroforese er en prosess for å skille stammer av DNA ved å presse den gjennom en gel plassert i en oppvarmet (og dekket) bord. Den porousness av gelen medfører at større fragmenter for å separere først mens mindre fragmenter fortsette gjennom gelen. Siden det første eksperimentell bruk i 1930-årene, har gelelektroforese blitt raffinert ved bruk av forskjellige typer av gel. Fra og med sukrose og deretter stivelse geleer, DNA separasjon i elektroforese kraftig økt med moderne bruk av agarose og acrylaminde geler. Med utviklingen av kapillær elektroforese, har visse fordeler og ulemper blitt klart for begge metodene. Agarosegel

Agarose gel er lett strømmet for bruk og prøver kan lett gjenopprettes. Gelen er også sterkt modifiserbare å øke avstanden mellom store og små DNA-molekyler. Siden det er laget av et sukker som finnes i tang, er agarose billigere enn alternativene og en tryggere gel produkt for bruk i elektroforese.
Akrylamidgel

Som agarose, akrylamid er lett å endre. Med en høyere belastningskapasitet, kan det kjøre flere prøver på samme. Den viktigste fordelen er at i løpet agarose akrylamid har mindre porer, noe som gjør det bedre egnet for separering av mindre DNA-molekyler som agarosegel ikke ville være i stand til å separere. Imidlertid er boblende et større problem for akrylamid, og siden akrylamid er en nervegift, kan det være svært farlig å jobbe med.
Kapillær elektroforese

Fordi varme oppløses raskt i polymeren, kapillær elektroforese tar mindre tid enn geler; minutter i forhold til timer. I tillegg, siden resultatene er overvåkes elektronisk hele prosessen kan automatiseres. Imidlertid kan kapillær elektroforese ikke kjøres så mange prøver ved samme tid som geler, og maskinene (priset på over $ 100.000 pr enhet) og reagenser koste betydelig mer enn gelen mulighet for separering, slik at de fleste laboratorier ikke har tilgang til den teknologi.